南京晓庄学院地处"六朝古都"南京学校前身是由伟大的人民教育家陶行知先生于1927年3月创办并任校长的晓庄试验乡村师范。同年10月著名教育家蔡元培任学校董事长并在校执教且亲书"教学做合一"校训著名乡村教育家赵叔愚任第一院 (小学师范院) 院长著名教育家陈鹤琴任学校指导员及第二院(幼稚师范院)院长。1951年经周恩来总理批准复办南京晓庄学校。

1991年促进南京市教育事业的发展经原国家教委批准原南京市师范专科学校与南京教育学院合并。2000年3月为进一步实施南京市"科教兴市"战略适应地方经济社会发展对人才的需求经国家教育部批准由原南京市师范专科学校、南京教育学院、南京市晓庄师范学校组合新建南京晓庄学院"实行省市共同建设、以市为主的办学体制学校设置以师范教育为主承担南京市中小学教师的培养和培训任务并适当发展非师范教育。"实现了陶行知先生"回国三愿"中创办"晓庄学院"的意愿。